تصاحب جيني

الكشف عن طريق الحساب

وفي هذا الصدد، يمكن استنتاج التوافق المشترك بين الأنواع المختلفة من تسلسلها الجينومي. يتم ذلك عادة باستخدام نسخة من خوارزمية MCScan ، التي تجد كتل متزامنة بين الأنواع من خلال مقارنة جيناتها المتماثلة والبحث عن أنماط مشتركة متداخلة مشتركة على مقياس كروموسومي أو مترابط. عادة ما يتم تحديد التماثلات على أساس درجات بت عالية التي تحدث بين الجينومات المتعددة. من هنا، يتم استخدام البرمجة الديناميكية لتحديد أفضل مسار لتسجيل الجينات المتجانسة المشتركة بين الأنواع، مع الأخذ بعين الاعتبار فقدان الجينات المحتمل والكسب الذي ربما حدث في التاريخ التطوري للنوع.

التصاحب الجيني المشترك

وفي هذا الصدد، يستعمل التصاحب الجيني على نطاق واسع في دراسة الجينوم المعقد، حيث يسمح الجينوم المقارن بوجود الجينات وربما وظيفتها في كائن نموذجي أبسط لاستنتاج تلك الموجودة في كائن أكثر تعقيدًا. مثلًا، يحتوي القمح على جينوم كبير ومعقد للغاية يصعب دراسته. في سنة 1994 أظهر البحث الذي أجراه مركز جون إينيس في إنجلترا والمعهد الوطني للأبحاث الزراعية في اليابان أن جينوم الأرز الأصغر كان له بنية وراثية مشابهة لتلك الموجودة في القمح. وجدت دراسة أخرى أن الكثير من الحبوب متزامنة وبالتالي يمكن استخدام نباتات مثل الأرز أو العشب كنموذج للعثور على الجينات أو العلامات الجينية ذات الأهمية التي يمكن استخدامها في تربية القمح والبحث. في هذا السياق، كان الترادف ضروريًا كذلك في تحديد منطقة مهمة للغاية في القمح، وهو موقع PH1 الذي يشارك في استقرار الجينوم والخصوبة، والذي تم تحديده باستخدام معلومات من المناطق المتزامنة في الأرز والعشب.

من جانب آخر، يصف التصاحب الجيني المشترك (المعروف كذلك باسم التزامن المحفوظ) التوطين المشترك المحفوظ للجينات على الكروموسومات من الأنواع المختلفة. أثناء التطور،  قد تؤدي إعادة الترتيب إلى الجينوم مثل انتقال الكروموسومات إلى فصل موقعين، مما يؤدي إلى فقدان التزامن بينهما. على العكس من ذلك، يمكن أن تنقل الانتقالات قطعتين منفصلتين سابقًا من الكروموسومات معًا، مما يؤدي إلى اكتساب التزامن بين المواقع. يمكن للتزامن المشترك الأقوى من المتوقع أن يعكس الاختيار للعلاقات الوظيفية بين الجينات المتزامنة، مثل مجموعات الأليات التي تكون مفيدة عندما تُورث معًا، أو الآليات التنظيمية المشتركة.

علاوةً على ذلك، وهي المحددات الرئيسية لخطة جسم الحيوان والتي تتفاعل مع بعضها البعض بطرق حرجة، وبشكل أساسي في جميع أنحاء مملكة الحيوان.

علاوةً على ذلك، مثلًا، يتم الحفاظ على ترتيب الجينات في عنقودية النحت (Hox cluster)

علاوةً على ذلك، يستعمل المصطلح أحيانًا كذلك لوصف عملية الحفاظ على الترتيب الدقيق للجينات على كروموسوم ينتقل من سلف مشترك. على الرغم من رفض الكثير من علماء الوراثة استخدام هذا المصطلح.

في هذا الإطار، إن تحليل التزامن من منطلق ترتيب الجينات له عدة تطبيقات في علم الجينوم. التصاحب الجيني المشترك هو أحد المعايير الأكثر موثوقية لتأسيس علم تركيب المناطق الجينومية في الأنواع المختلفة. فضلًا عن ذلك، يمكن للحفظ الاستثنائي للتزامن أن يعكس العلاقات الوظيفية الهامة بين الجينات.

وفي السياق ذاته، يمكن كذلك استخدام أنماط الفواصل المتزامنة أو الفواصل المتداخلة كأحرف لاستدلال العلاقات الجينية بين عدة أنواع، وحتى لاستنتاج تنظيم الجينوم لأنواع الأسلاف المنقرضة. يتم أحيانًا التمييز بين النوعي بين الحَكَم العظمي، والحفاظ على التشابه في أجزاء كبيرة من الكروموسوم، والحَقْنُ العَضَلِيّ، والحفاظ على التشابه لبضعة جينات فقط في كل مرة.

في هذا الإطار، يستعمل التصاحب الجيني كذلك على نطاق واسع في علم الجينوم الميكروبي. في المستجذريات والأمعائيات، تشفر الجينات المتزامنة عددًا كبيرًا من وظائف الخلية الأساسية وتمثل مستوى عالٍ من العلاقات الوظيفية.

في علم أصول الكلمات

إضافةً إلى ذلك، في إشارة إلى نفس ترتيب الجينات في سلسلتين (متماثلتين) من الحمض النووي (أو الكروموسومات).

• التصاحب الجيني أو التزامن هو مصطلح حديث «يعني على نفس الشريط» ؛
• و في اليونانية :
• σύν ، syn = مع + ταινία ، tainiā = النطاق