نطاق بروتين

قبل الخوض في التفاصيل، نطاق بروتين أو مجالات بروتين هو جزء مكتمل من سلسلة بروتين معين ذات تركيب مجسم (في ثلاثة أبعاد) قد تنشأ، وتكون لها وظيفة حيوية، ويمكنها البقاء منفصلة عن بقية سلسلة البروتين. يكوّن كل نطاق domain من نظام متماسك في ثلاثة أبعاد ويمكنه البقاء مستقرا وقد يتطابق على نفسه.

• انظر كذلك
• إشارة تصدير نووي
• بروتين اندماجي
• بروتين
• علم الأحياء
• كيمياء عضوية
• بروتين ثانوي البنية

نطاقات غير معروف وظيفتها (DUFs)

ومن ناحية أخرى، تشكل النطاقات وحدات وظيفية، مثل النطاق EF hand domain الخاص ب كالمودولين. ونظرا لكون النطاقات تكون مستقرة وغير معتمدة على بعضها البعض، فيمكن استبدال نطاق بنطاق آخر بواسطة التقنية الجينية؛ أي استبدال نطاق بنطاق آخر لإنتاج بروتين اندماجي.

ومن ناحية أخرى، كثير من نطاقات البروتين لا تعرف لها وظيفة؛ ولهذا تسمى نطاقات لا وظيفية domain of unknown function, DUF . وتوجد تلك النطاقات كثيرا؛ فمثلا في البكتيريا وجدت نحو 2700 من النطاقات المختلفة ولا تعرف لها وظائف حتى الآن. وفي حقيقيات النوى توجد نحو 1500 من حلبات البروتين ومن ضمنها 800 حلبة بروتين توجد في بكتيريا (بواقع عام: 2013).

في هذا الإطار، تختلف المجالات (النطاقات) في طولها بين 25 حمض أميني إلى 500 حمض أميني. ومن أقصر النطقات نجد «أصابع الزنك» zinc fingers وفيه تعمل ذرة معدنية أو «قنطرة سلفيد ثنائية» على استقراره.

من جهة ثانية، الكثير من البروتينات تكون مكوّنة من نطاقات بنائية. وقد يظهر نطاق معين domain في الكثير من البروتينات المختلفة. وتستعمل الجزيئات الكبيرة النطاقات كوحدات بنائية؛ وترتبط ببعضها البعض بأنظمة مختلفة مكونة بروتينات ذات وظائف مختلفة.

كذلك، وقد قام الباحث «جوداكر» وزملاؤه في سنة 2013 بفصل 238 DUFs (eDUFs) ضرورية في البكتيريا، وقد أدى اقتلاعها من الخلايا إلى موت الخلايا.