تي-كوفي

تي-كوفي T-coffee

هو مجموعة من الأدوات للحوسبة تتيح مقارنة عدة سلاسل بيولوجية؛ مثل: (بروتينات,DNA,RNA).

له الكثير من التطبيقات :

وفي هذا الصدد، Expresso and 3D-Coffee, R-Coffee , M-coffee, Pro-coffee و غيرها.

من جانب آخر، وهناك خاصية هامة يوفرها وهي قدرته على الجمع بين أساليب مختلفة وأنواع البيانات المختلفة.

علاوةً على ذلك، و القدرة على تحديد حدوث (motifs(Mocca,و كل ذلك يتم بتحديد السلسلة اولا من برمجية FASTA و هي الأكثر استخداماً.

وفي هذا السياق، يتم استخدامه لتحديد الاماكن المهمة في السلسلة ومناطق المحاذاة، ولإيجاد الاحماض الامينية التي لا تسمح بحدوث الطفرات، لديه ميزات متقدمة لتقييم نوعية المقارنة

كيفية معاينة النتيجة

• BAD : بنفسجي-اخضر
• AVG : اصفر
• GOOD : احمر
• المرجع

كذلك، النتيجة ستظهر السلاسل البيولوجية بألوان تحدد مناطق المحاذاة، شدة التطابق بينها يتم معيانتها حسب الالوان

كيفية الاستخدام

كذلك، نقوم بفتح البرنامج واختيار نوع التطبيق المطلوب وبعدها نقوم بوضع السلاسل البيولوجية التي نود مقارنتها.