مافت

كيفية استخدام البرنامج

وفي هذا الصدد، تشغيل أداة من نموذج الويب هو عملية متعددة خطوات بسيطة، بدءا من أعلى الصفحة واتباع الخطوات إلى الأسفل.

ومن جهة أخرى، لاحظ أن يتم التحقق من صحة المعلمات قبل إطلاق الأداة على الخادم وفي حال وجود مجموعة مفقودة أو خاطئة من المعلمات، سيتم إعلام المستعمل مباشرة في النموذج.

من جانب آخر، • في الخطوات التالیة، یتوفر للمستعمل إمکانیة تغییر معلمات الأداة الافتراضیة

في هذا الإطار، • وأخيرا، فإن الخطوة الأخيرة هي دائما خطوة تقديم الأداة، حيث يمكن للمستعمل تحديد عنوان ليترافق مع النتائج وعنوان بريد إلكتروني لإعلام البريد الإلكتروني. باستخدام زر تقديم سوف تقدم على نحو فعال المعلومات المحددة سابقا في شكل لإطلاق الأداة على الخادم

الخطوة 1 - تسلسل

إضافةً إلى ذلك، كل أداة لديها ما لا يقل عن 2 خطوات، ولكن أغلبهم لديهم أكثر من ذلك:

ومن ناحية أخرى، • الخطوات الأولى هي عادة حيث يقوم المستعمل بتعيين مدخلات الأداة (مثل التسلسلات وقواعد البيانات ...)

تسلسل تحميل الملف

• المراجع
• روابط خارجية
• MAFFT Online Server
• MAFFT server at EBI

كذلك، يمكن تحميل ملف يحتوي على ثلاثة أو أكثر من التتابعات الصالحة بأي شكل (غغ، فاستا، إمبل، جينبانك، بير، نبرف، فيليب أو ونيبروتكب / سويس-بروت) واستخدامها كمدخلات لمحاذاة التسلسل المتعددة. قد تنتج ملفات معالج ورد نتائج غير متوقعة كما قد تكون الأحرف المخفية / التحكم موجودة في الملفات. فمن الأفضل لحفظ الملفات مع خيار تنسيق أونيكس لتجنب أحرف ويندوز المخفية. يوجد في الوقت الحالي حد تحميل ملف مكون من 500 تسلسل و 1 ميغابايت من البيانات.يمكن تحميل ملف يحتوي على ثلاثة أو أكثر من التتابعات الصالحة بأي شكل (غغ، فاستا، إمبل، جينبانك، بير، نبرف، فيليب أو ونيبروتكب / سويس-بروت) واستخدامها كمدخلات لمحاذاة التسلسل المتعددة. قد تنتج ملفات معالج ورد نتائج غير متوقعة كما قد تكون الأحرف المخفية / التحكم موجودة في الملفات. فمن الأفضل لحفظ الملفات مع خيار تنسيق أونيكس لتجنب أحرف ويندوز المخفية. يوجد في الوقت الحالي حد تحميل ملف مكون من 500 تسلسل و 1 ميغابايت من البيانات.

تسلسل نافذة الإدخال

من جهة ثانية، يمكن إدخال ثلاثة متواليات أو أكثر لتكون محاذية مباشرة في هذا النموذج. يمكن أن تكون متواليات في غغ، فاستا، إمبل، بنك الجينات، بير، نبرف، فيليب أو ونيبروتكب / السويسري بروت الشكل. لا يتم قبول التسلسلات المنسقة جزئيا. إضافة عائد إلى نهاية التسلسل قد يساعد بعض التطبيقات على فهم المدخلات. لاحظ أن استخدام البيانات مباشرة من معالجات النصوص قد يؤدي إلى نتائج غير متوقعة حيث قد تكون الأحرف المخفية / التحكم موجودة. يوجد في الوقت الحالي تسلسل المدخلات تسلسل 500 تسلسل و 1 مب من البيانات.

كلوستال / MAFFT / PRRN at GenomeNet

ClustalW / TCoffee / MAFFT in MyHits, SIB