ميليتوم

مراجعة تسجيلات أنسجة الميليتوم

• المراجع
• روابط خارجية
• اتحاد برنامج أطلس الجزيئات الحيوية البشرية

وفي هذا السياق، بمجرد أن يتم استيعاب حزمة بيانات المليتوم بواسطة مكون مشاركة البنية التحتية في برنامج أطلس الجزيئات الحيوية البشرية Consoritum، يقوم المستعمل الميليتوم بزيارة واجهة مستعمل الاستكشاف للتحقق من صحة حجم وموضع واتجاه جميع كتل الأنسجة. تم توضيح المعلومات حول هذه العملية في واجهة مستعمل التسجيلSOP ضمن قسم "التحقق من تسجيلك باستخدام واجهة مستعمل الاستكشاف." إذا كانت هناك حاجة إلى تصحيحات أو تعديلات، يتصل المستعمل الصغير بالميسر لإجراء التحديثات.

برنامج أطلس الجزيئات الحيوية البشرية المرئي البشري

مركز البنية التحتية السيبرانية لعلوم الشبكات (CNS)

تحديد كتل الأنسجة

من جانب آخر، يسرد جدول بيانات بحث قيم مفصولة بفواصل المقدم كجزء من حزمة البيانات معرفات الميليتوم التي تم تعيينها مسبقًا لكل كتلة في شبكة القطع. يتم تعيين معرفات الميليشيات باستخدام أرقام للمحور y، وحروف المحور x، والحروف "b" أو "t" للجانب السفلي/العلوي. يسجل مستعمل الميليتوم معرف كتلة الأنسجة المعينة لكل عينة نسيج بناءً على موقعها داخل الميليتوم. يسمح ذلك بتوصيل البيانات من عينة الأنسجة بموقع كتلة نسيج افتراضي معين داخل العضو المرجعي.

استخدامه في قطع الأنسجة

وعلى صعيد آخر، يتم استخدام صينية الميليتوم مع سكين الكربون أو الفولاذ المقاوم للصدأ. بمجرد قطع العضو، يجب الحفاظ على موقع وتناوب جميع كتل الأنسجة. تم استخدام صواني مكعبات الثلج بنجاح للحفاظ على كتل الأنسجة منفصلة ومرتبة. نظرًا لأن الطباعة ثلاثية الأبعاد لميليتوم يمكن أن تستغرق عدة ساعات، فإن الشركات الصغيرة ومتوسطة الأعضاء المهتمة بالحصول على الكثير من مكعبات الأنسجة من عضو كامل يجب أن تطبع مسبقًا الميليتوم من الأحجام القياسية وتحتفظ بها في مختبراتها. وهذا يسمح بقطع الأنسجة البشرية فور توفرها.

نماذج

ومن جهة أخرى، يُنشئ مصمم نماذج ميليتوم ملفات ثلاثية الأبعاد يمكن طباعتها يشكل ثلاثي الأبعاد ويكون مسؤولاً عن إنشاء كتل افتراضية ثلاثية الأبعاد متطابقة للاستخدام في واجهة مستعمل HuBMAP CCF أو البيئات الافتراضية الأخرى. OpenScad، مصمم نماذج ثلاثي الأبعاد مفتوح المصدر، قائم على التعليمات البرمجية، يُستعمل لإنشاء هندسة ثلاثية الأبعاد. تستعمل جميع نماذج الميليتوم أعضاء مرجعية ثلاثية الأبعاد من مشروع مكتبة الولايات المتحدة الوطنية للطب المرئي البشري المتاح عبر بوابة أطلس المرجع البشري.

إضافةً إلى ذلك، يضمن استخدام نفس الشكل الهندسي ثلاثي الأبعاد لكلا الغرضين أن الأبعاد والنسب والسمات الأخرى الخاصة بميليتوم معين تتطابق في كل من النسختين المادية والظاهرية.

علاوةً على ذلك، يوفر بيانات ثلاثية الأبعاد لكتل الأنسجة المقطوعة بالميليتوم نفسه لاستخدامها في واجهة ويب مثل EUI الخاص ببرنامج أطلس الجزيئات الحيوية البشرية .

النموذج ثلاثي الأبعاد الناتج له استخدامان رئيسيان:

علاوةً على ذلك، يوفر بيانات هندسية ثلاثية الأبعاد يمكن طباعتها بشكل ثلاثي الأبعاد، مما يؤدي إلى إنشاء ميليتومي مادي. في هذه الحالة، يتم تصدير الملفات ثلاثية الأبعاد بتنسيق لغة المثلث القياسية واستيرادها إلى تطبيق طباعة ثلاثي الأبعاد مثل Ultimaker Cura أوضبط المادة.

وصول واستخدام

وفي السياق ذاته، يمكن طباعة ملف لغة المثلث القياسية ثلاثي الأبعاد في المنزل أو إرساله إلى خدمة الطباعة التجارية. يربط ملف بحث قيم مفصولة بفواصل معرفات الميليتوم (التي تشير إلى كتلة نسيج على الميليتوم) بمعرفات برنامج أطلس الجزيئات الحيوية البشرية (كتل الأنسجة المادية المقطوعة بالمليتوم). يوفر ملف بيانات وصفيةCSV البيانات الوصفية التالية حول الميليتوم: العضو، والجنس، والأطراف (إن أمكن)، وحجم كتلة الأنسجة، وحجم شبكة القطع التي يستعملها الميليتوم. يحتوي كذلك على بيانات وصفية حول كل معرّف من الميليتوم في لغة المثلث القياسية: موضع x ، y ، z- و x ، البعد y.

إضافةً إلى ذلك، ملف بحث قيم مفصولة بفواصل يربط معرفات الميليتوم المحددة مسبقًا بمعرفات برنامج أطلس الجزيئات الحيوية البشرية.

وعلى صعيد آخر، يزور أحد المستعملين الميليتوم موقع الويب HRA Millitome للوصول إلى الميليتومات المترجمة مسبقًا للأعضاء المختلفة واختيار أفضل الأعضاء المطابقة من حيث جنس المتبرع، وحيوية الأعضاء (إن أمكن)، وحجم العضو، ومسافات القطع. يقوم المستعمل لاحقًا بتنزيل حزمة ملف بيانات للمليتوم المخصص الذي يتكون من ثلاثة ملفات:

وفي هذا الصدد، ملف لغة المثلث القياسية يستعمل لطباعة ثلاثية الأبعاد لأداة قطع الأنسجة الميليتومية.

إضافةً إلى ذلك، ملف بيانات وصفية قيم مفصولة بفواصل يحتوي على معلومات حول المليتوم لضمان إمكانية التكاثر.